Kinoteka e Republikës së Maqedonisë së Veriut përmes projekteve të saj kërkimore deri më tani ka arritur të mbledhë një sasi të madhe të dhënash për shfaqjen dhe zhvillimin e kinematografisë maqedonase. Për më tepër, përmes projekteve të tilla Kinoteka ka grumbulluar materiale të rëndësishme empirike, dokumente dhe filma që janë xhiruar në Maqedoni ose i referohen Maqedonisë në periudhën deri në fund të Luftës së Dytë Botërore.

Ky lloj i projekteve kërkimore mund të ndahet në dy grupe: njëri është organizimi i simpoziumeve vendase dhe ndërkombëtare (nga të cilat më pas botohen përmbledhjet e punimeve), dhe i dyti janë qëndrimet kërkimore në institucione dhe arkiva përkatëse në vend dhe në botë. Në grupin e parë, të ashtuquajturat simpoziumet vendase “Fillimet dhe faza e parë e kinematografisë maqedonase të pasluftës” dhe “Fillimi i dytë i filmit maqedonas” (hulumtimi ndërdisiplinor dhe ekipor i produksionit artistik maqedonas përmes simpoziumeve të organizuara), si dhe ato ndërkombëtare: “Kinematografitë e kombeve të vogla”, “Refugjatët dhe filmi” dhe “Filmi në kontekstin kulturor ballkanik”.

Në grupin e dytë, hulumtimi për zhvillimin e kinematografisë riprodhuese në periudhën 1897-1947, veprimtaria e Institutit të Higjienës nga Shkupi dhe kameramanit të tij Stevan Mishkoviq ndërmjet dy luftërave botërore, si dhe kërkimet në arkivat e filmit në Sofje, Beogradi, Zagrebi, Bukureshti, Budapesti, Roma, Vjena, Parisi, Londra, Koblenci, nga ku janë marrë filma dhe dokumentacion interesant për Maqedoninë, të regjistruara nga kineastët e huaj, deri në fund të Luftës së Dytë Botërore.

Përveç kësaj, Kinoteka e Maqedonisë çdo vit ndërmerr edhe projekte kërkimore afatshkurtra dhe afatgjata. Ndër hulumtimet e tjera afatshkurtëra janë bisedat/kujtimet e regjistruara dhe grumbullimi i materialit kujtimor, nga doajenët e kinematografisë maqedonase, duke përfshirë Trajçe Popov, Blagoja Drnkov, Koço Nedkov, Kiro Bilbilovski, Misho Samoilovski, Branko Mihajlovski, Gligor Pakovski, Ilija Milchin, Nikola Lazarevski, Vojne Petkovski, Nada Geshovska, Meri Boshkova, Dragomir Felba, Kole St.

Ndër projektet kërkimore afatgjata, sipas rëndësisë së tyre, veçohen: “Bibliografia filmologjike”, e cila duhet të përfshijë njësi bibliografike për filmin nga gazetat dhe periodikët nga viti 1897 deri në vitin 1944, “Metamorfozat dhe veçoritë stilistike të filmit artistik maqedonas”, “Historia e fotografisë në Maqedoni”, “Filmi amator në Maqedoni”. Maqedonia” dhe “Kinematografia riprodhuese në Maqedoni (1897-1947).

Një numër i madh punimesh që janë rezultat i hulumtimeve të kryera në Kinematekë, shfaqen në revistën Kinopis të botuar nga Kinemateka.